Le SRAS-CoV-2 a muté et est maintenant plus contagieux: dans une étude menée par le Sheffield COVID-19 Genomics Group, une variante est identifiée qui serait la cause la plus répandue des infections à coronavirus en Europe et dans le monde.
La capacité du virus à infecter les humains semble avoir augmenté, car le variant appelé D614G est plus infectieux, mais cela n'a aucune incidence sur sa létalité. En effet, les virus mutent généralement sous des formes moins agressives pour assurer leur survie.
Les travaux ont jusqu'à présent été menés en laboratoire, où la capacité infectieuse a été mesurée à l'aide de cellules humaines et de la souche mutante isolée du virus après séquençage génomique. La mutation apparaît "petite" mais décisive, car c'est sur la glycoprotéine de pointe que le virus utilise pour pénétrer dans les cellules et les infecter.
En laboratoire, oui, mais en comparant les données avec les données épidémiologiques disponibles qui montreraient comment la variante D614G du virus aurait très vite supplanté la précédente, appelée G614, peu de temps après son apparition sur Terre, avec des échantillons géographiques montrant un changement significatif dans la population virale de l'original à la nouvelle souche du virus.
© Université de Sheffield
«Nous avons séquencé les souches de SRAS-CoV-2 à Sheffield depuis le début de la pandémie et cela nous a permis de démontrer avec nos collaborateurs que cette mutation était devenue dominante dans les souches en circulation - explique Thushan de Silva, co-auteur de l'ouvrage - L'étude un examen approfondi par les pairs publié aujourd'hui le confirme et aussi que la nouvelle variante de mutation du génome D614G est plus infectieuse en laboratoire ».
Mais pas d'alarme particulière .
Les données fournies par notre équipe à Sheffield suggèrent que la nouvelle souche est associée à des charges virales plus élevées dans les voies respiratoires supérieures des patients atteints de Covid-19, ce qui signifie que la capacité du virus à infecter les personnes pourrait être augmentée - heureusement en à ce stade, il ne semble pas que les virus avec D614G provoquent des maladies plus graves ».
Un travail possible grâce au partage de dizaines de milliers de séquences qui nous ont permis d'identifier l'émergence d'une variante qui est rapidement devenue la forme dominante au niveau mondial .
De nouvelles expériences de soutien, un séquençage plus large, des données cliniques et des modèles statistiques améliorés sont désormais disponibles, mais, soulignent les chercheurs, des analyses de laboratoire supplémentaires sur des cellules vivantes sont encore nécessaires pour déterminer toutes les implications de la mutation.
C'est extraordinaire pour moi - commente Will Fischer qui a collaboré à la recherche - que cette augmentation de l'infectiosité ait été détectée par une observation attentive des données de séquence seules et que nos collègues expérimentateurs puissent la confirmer avec des virus vivants en si peu de temps ».
Les chercheurs continueront de surveiller d'autres mutations du virus pour aider à lutter contre Covid-19 dans le monde .
Le travail a été accepté pour publication sur Cell.
Sources de référence: Université de Sheffield / Cell
