Il existe une forte relation entre le microbiome intestinal et le cancer colorectal. La population bactérienne intestinale d'une personne touchée par ce type de tumeur a en effet des caractéristiques spécifiques.
Des bactéries spécifiques et certains micro-organismes peuvent être associés à un risque accru de cancer colorectal. Le microbiote intestinal, en fait, c'est-à-dire l'écosystème complexe de bactéries, champignons et virus des personnes touchées par ce type de tumeur, aurait des caractéristiques très spécifiques. Pour cette raison, cela permettrait un bon diagnostic précoce.
Cela a été révélé par un groupe de chercheurs internationaux coordonné par le département Cibio de l'Université de Trente, qui dans une étude publiée dans Nature Medicine a analysé des milliers d'échantillons arrivant précisément à la corrélation entre la composition du microbiome intestinal et le cancer colorectal , un néoplasme qui se développe à partir de groupes de cellules de la paroi interne de la dernière partie du système digestif.
Les causes de ce type de cancer comprennent des habitudes alimentaires et un mode de vie incorrects, mais aussi des facteurs génétiques. Aujourd'hui, de nouvelles recherches suggèrent que le microbiome intestinal peut également jouer un rôle important dans la maladie, ouvrant la voie à un diagnostic précoce .
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Pour arriver à ce résultat, les chercheurs ont analysé un millier d'échantillons fécaux, à l'aide de la métagénomique computationnelle, prélevés sur des populations très différentes: des États-Unis au Japon, en passant par le Canada, la Chine, l'Italie et d'autres pays européens. Grâce à des méthodes de bio-informatique développées ad hoc, le matériel génétique des échantillons a été séquencé massivement et en parallèle, identifiant les organismes et les gènes microbiens présents.
«Le séquençage massif du matériel génétique présent dans les échantillons nous permet d'identifier, grâce à des méthodes bioinformatiques avancées, les organismes microbiens et les gènes présents dans le microbiome intestinal», explique le bioinformaticien Nicola Segata, coordinateur de l'étude.
Dans des échantillons fécaux de personnes atteintes d'un cancer colorectal, la présence d'un ensemble de bactéries marquant la maladie a été observée, à commencer par Fusobacterium nucleatum, déjà associé au néoplasme. Mais aussi une dizaine d'autres types de bactéries qui renforceraient cette association.
«Ce qui est intéressant, c'est que l'ensemble des bactéries fortement associées au cancer colorectal est le même dans des populations distinctes qui ont généralement des microbiomes intestinaux assez différents», dit Segata.
Microorganismes et plus: copies d'un gène codant pour une enzyme (cutC) , impliquée dans la production de triméthylamine, molécule associée par certaines études à un risque plus élevé de développer le cancer colorectal:
«Nous avons vu que chez les personnes atteintes de cancer, le microbiome a un nombre statistiquement plus élevé de copies d'un gène qui code pour une enzyme appelée cutC. Cette enzyme est impliquée dans le métabolisme
de la choline - un composé organique issu de l'alimentation - et la production consécutive d'une molécule (triméthylamine) qui a été associée dans d'autres études à
un risque plus élevé de contracter un cancer colorectal.
Ainsi, trouver un lien fort entre le microbiome intestinal et le cancer colorectal peut conduire à la découverte immédiate d'un débouché important en termes de diagnostic précoce.
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Germana Carillo
